• Phần lõi (Core) vùng khởi động
  • Vị trí khởi đầu phiên mã (TSS)
    • vị trí khoảng -35 tính ngược dòng về thượng nguồn gen, từ vị trí bắt đầu phiên mã là +1 (xem hình 1).
  • Vị trí bám của RNA polymerase
    • RNA-polymerase I: phiên mã gene mã hóa cho RNA ribosome
    • RNA-polymerase II: phiên mã gene mã hóa cho mRNA và một số RNA nhân nhỏ (small nuclear RNA)
    • RNA-polymerase III: phiên mã gene mã hóa cho RNA vận chuyển và những RNA nhỏ khác
  • Ví trí bảm của các nhân tố phiên mã
• Phần cận biên (Proximal) vùng khởi động
  • vị trí khoảng -250
  • Điểm bám của một số nhân tố phiên mã đặc biệt
• Phần ngoại biên (Distal) vùng khởi động
  • ví trí xa hơn ở phía thượng nguồn (upstream) (ngoại trừ enhancer hoặc các vùng điều hòa không phụ thuộc vị trí và chiều)
  • Điểm bám của một số nhân tố phiên mã đặc biệt

Vùng khởi động là những nhân tố quan trọng phối hợp với enhancer, silencer, nhân tố liên kết trong việc quyết định mức độ biểu hiện của một gene nhất định.